برخی منابع حقوق بشری می‌گویند در روزهای اخیر ده‌ها شهروند یهودی در برخی شهرهای ایران به مراکز امنیتی احضار و بازجویی شده‌اند.
در میان این منابع، خبرگزاری هرانا، ارگان خبری مجموعه حقوق بشر ایران، روز شنبه هفتم تیر گزارش داد که از دوم تیرماه تاکنون «دست‌کم ۳۵ شهروند یهودی در شهرهای تهران و شیراز به مراکز امنیتی احضار و بازجویی شده‌اند».
این گزارش حاکی است پرسش‌های مأموران عمدتاً در مورد تماس‌های خانوادگی این افراد با بستگان‌شان در اسرائیل بوده است.
به‌نوشتۀ هرانا، خانواده‌های برخی احضارشدگان گفته‌اند که مسئولان امنیتی تلاش کرده‌اند به آن‌ها «اطمینان خاطر بدهند که قصد ایجاد فشار بر جامعۀ یهودیان را ندارند و مجموعه احضارها متأثر از فضای جنگ اخیر اسرائیل و ایران، با هدف جمع‌آوری اطلاعات و "پیشگیری از ارتکاب جرم" بوده است».
یدیعوت آحرونوت جمعه ششم تیر نوشته بود فعالان جوامع یهودی در اسرائیل و آمریکا خبر داده‌اند که تشکیلات امنیتی و اطلاعاتی جمهوری اسلامی ایران در روزهای اخیر شماری از یهودیان ایران را به ظن «همکاری» با اسرائیل «بازداشت کرده‌اند».
این روزنامه نوشت شماری از حاخام‌ها و رهبران جامعه یهودیان در تهران و شیراز در میان این بازداشت‌شدگان بوده‌اند.
هاآرتص نیز جمعه به‌نقل از یک گروه حقوق بشری زنان فرانسوی-ایرانی به بازداشت حاخام‌ها و فعالان یهودی در تهران و شیراز اشاره کرد.
به‌نوشتۀ یدیعوت آحرونوت، تلفن‌های همراه و رایانه‌های اعضای یک خانواده توقیف شد. این گزارش حاکی است مردان، ازجمله یک حاخام، هنوز در بازداشت هستند اما زنان پس از بازجویی آزاد شده‌اند.
پیشتر برخی فعالان رسانه‌ای نیز تصاویری از پیامک‌هایی را در شبکه‌های اجتماعی منتشر کردند با این توضیح که این پیامک‌ها از سوی انجمن کلیمیان ایران ارسال شده و در آن‌ها «هرگونه فعالیت در فضای مجازی در مورد مسائل سیاسی و جنگی، و همچنین تماس با خارج از کشور» ممنوع اعلام شده است.
رادیوفردا مستقلاً نمی‌تواند این اطلاعات را تأیید یا رد کند و مقامات قضایی و امنیتی جمهوری اسلامی ایران نیز در این‌باره خبری منتشر نکرده‌اند.
این در حالی است که رسانه‌های حکومتی در ایران روز پنجم تیرماه عکس‌هایی از یک گردهمایی یهودیان در کنیسای «ابریشمی» در تهران منتشر کردند با این توضیح که این تجمع در حمایت از رهبر جمهوری اسلامی و نیروهای مسلح برگزار شده است.
خبرگزاری حکومتی مهر نیز نوشت همایون سامیح نجف‌آبادی، نمایندۀ کلیمیان در مجلس شورای اسلامی و همچنین شماری از مردان جوان یهودی ایران که سربازان وظیفه در نیروهای مسلح ایران هستند، در مراسم کنیسای «ابریشمی» شرکت کردند و حمایت و وفاداری خود را از ایران ابراز داشته‌اند.
شمار یهودیان در ایران کمتر از ۱۰ هزار نفر برآورد شده است. این شمار زمان کوتاهی پیش از انقلاب اسلامی حدود یکصد تا ۱۲۰ هزار نفر بود. بخش عمده‌ای از یهودیان باقی‌مانده در ایران ساکن تهران و اصفهان هستند.
وزارت اطلاعات جمهوری اسلامی زمستان ۱۳۷۷ خورشیدی ۱۳ یهودی ساکن اصفهان و شیراز را به اتهام «جاسوسی» برای اسرائیل بازداشت کرد؛ سه نفر از آن‌ها بعد از محاکمه آزاد و ۱۰ نفر به حبس‌های چهار تا ۱۳ سال محکوم شدند.
زندانی شدن گروه ۱۳ نفره یهودیان شیراز و اصفهان با موجی از واکنش‌های دولت‌های غربی روبه‌رو شد و فرانسوا میتران، رئیس‌جمهور وقت فرانسه، برای آزادی آن‌ها تلاش گسترده انجام داد.
آخرین گروه از محکومان یهودی این پرونده بهمن‌ماه ۱۳۸۱ در زمان ریاست محمود هاشمی شاهرودی بر قوه قضائیه عفو و آزاد شدند.
